Ｄ１ＸにGPS付けて撮りました。
いつもの場所なんですけど。

Exif情報 [地図]
対応済みですね。

あれ？チョットずれていますね。
GPSの測地系は『Tokyo』です。

マピオンではほぼぴったりなんですけど。

もう、日本測地系（Tokyo)は、ありませんよ〜、日本は世界測地系に統一になってます。
が、地図（地図データ）の中には、まだ日本測地系の物もあります。
この場合、マピオンは、まだ日本測地系のままで、アルプスは世界測地系になります。

WGS84の方がいいのかな？
でも私の持っている地図どうも日本測地系（Tokyo)で正確に出ます。

使う地図に、よると思います。

注意点は国土地理院のHPに詳しく書いてありますので、参考にしてください。
http://www.gsi.go.jp/WNEW/LATEST/gpsmap/GPS_and_MAPs.htm

実際にその通りですね。
アルプスは私の住んでいる場所や撮影する場所の詳細地図まだ無いんですよ。
ゼンリンの地図やマップファンWebは日本測地系（Tokyo)みたいです。
世界測地系で詳細地図があればそちらへ乗り換えます。
プロアトラスSVくらいなのかな？
つい最近発売のゼンリンは日本測地系（Tokyo)とはっきり書いてありました。

カーナビ（ナビ研規格：ゼンリンさんとか）は、日本測地系で動いてるんですよね、その辺が世界測地系に移行出来てない一つなんですよね〜。
ナビ研の会員さんの所の地図が世界測地系に変わるの、まだだいぶ先でしょう（変わらないかも）。