デジカメWatchの大浦タケシは、D5000をニコンの新しいエントリーモデルと位置付けた。このクラスはD40やD60のように数字二桁の名称を使ってきたが、本機から四桁の名称になったとも指摘している。そのうえで大浦は、D5000をD90と「性能および機能的にたいへん近いカメラ」と評した。^{2レビュー デジカメWatch【新製品レビュー】ニコン「D5000」}

dpreviewは、ツインダイヤルや大容量バッテリー、ペンタプリズムファインダーを備える愛好家向けのD90よりは下、基本的なエントリー機よりは上に位置する「上位エントリー機」と見た。主な対象には、これまで一眼レフを持ったことのないテクノロジーに明るい層と、旧世代のエントリー機からの買い替え層を挙げている。^{4レビュー Digital Photography ReviewNikon D5000 Review}All Aboutの清水博之も、スペックは「エントリークラスというよりも、ミドルクラスのそれに近い」とし、従来のエントリー機に飽き足らないユーザーに向けた「野心的な製品」と評した。^{5レビュー All AboutニコンD5000はエントリーモデル？ 専門家がレビュー}

撮像素子は、先代D60の有効1020万画素CMOSから、D90と同じ有効1230万画素CMOSに変わった。AF測距点もD60の3点からD90と同じ11点に増え、連写速度は毎秒3コマから毎秒4コマに上がった。同時期のD90は毎秒4.5コマである。液晶モニターはD60の2.5型23万ドットの固定式から、2.7型23万ドットのバリアングル方式になった。ニコンの一眼レフでバリアングル液晶を搭載したのは本機が初めてである。^{4レビュー Digital Photography ReviewNikon D5000 Review}

D60になかった動画撮影機能も加わり、1,280×720ピクセル、約24fps、最長約5分の記録に対応した。新たに搭載したライブビューでは、3D-トラッキングAFを含む四つのAFモードを選べる。静音撮影モードも新機能として備えた。^{2レビュー デジカメWatch【新製品レビュー】ニコン「D5000」}

dpreviewは、上位エントリー機という発想自体は目新しいものではないとし、同様の市場を狙う競合機としてキヤノンEOS 500D（国内名EOS Kiss X3）とオリンパスE-620を挙げた。そのうえで、D5000のファインダーはEOS 500Dよりわずかに小さいと指摘している。E-620もD5000と同じ有効1200万画素級のセンサーを載せており、3機種の中ではE-620が最も小型で、とりわけ奥行きの点で小さいと評した。^{4レビュー Digital Photography ReviewNikon D5000 Review}

デジカメWatchの大浦は、D5000のバリアングル液晶がオリンパスのフリーアングル液晶と機構的には似ているとしつつ、オリンパスが横方向にジョイントを持つのに対し、D5000は液晶モニターの下部にジョイントを置く方式だと指摘した。ボディ内RAW現像機能については、ペンタックスの一眼レフでは以前から馴染みのある機能だと紹介している。^{2レビュー デジカメWatch【新製品レビュー】ニコン「D5000」}

ニコンは発表にあたり、コンパクトデジタルカメラからのステップアップ層と、デジタル一眼レフカメラが初めての層を主な対象とし、エントリー層のニーズに応えることを開発の狙いに掲げた。^{1プレス 株式会社ニコンデジタル一眼レフカメラ「ニコン D5000」の発売について}デジカメWatchの大浦タケシは、取材の機会にニコン関係者から「ユーザーの意見を反映したらこのようなカメラになった」との説明を受けたと書き、他社以上に顧客満足度にこだわる同社の思想を具現化したものだと評している。^{2レビュー デジカメWatch【新製品レビュー】ニコン「D5000」}

価格.comのレビューでは61件で総合評価4.42点、星5の評価が54%、星4が39%を占める。項目別で最も高いのは携帯性の4.39、最も低いのは液晶の3.64である。レビューではコンパクトで軽量な作り、バリアングル液晶による自由な撮影、初心者にも分かりやすい操作性が評価される一方、AFの精度、液晶の解像度の低さ、連写の遅さ、バッテリー持ちの短さが不満点に挙がっている。^{6レビュー 価格.comニコン D5000 ボディ レビュー評価・評判}

専門媒体では、デジカメWatchの大浦がD5000を「次元の異なる完成度」と評し、静音撮影モードについては「上位機にもぜひ採用してほしく感じた」と述べた。ただし、三脚にセットした際に液晶が開ききらないことがある点も指摘している。^{2レビュー デジカメWatch【新製品レビュー】ニコン「D5000」}All Aboutの清水は、バリアングル液晶とライブビュー撮影の組み合わせを「非常に面白い機種が出てきたと言える」と評価した。一方で、本体重量560gを「エントリークラスとしてはかなりの重量級」とし、ISO感度をメニュー経由でしか変更できない操作性を「失敗だと個人的には思う」と書いている。^{5レビュー All AboutニコンD5000はエントリーモデル？ 専門家がレビュー}